Чтобы обезопасить страну на случай нового нападения Годзиллы, группа ученых взялась за создание ответного гиганта — управляемого робота, который мог бы обладать всеми функциями живого монстра. В проекте использовали не только металл и электронику: для придания машине присущих существу реакций и способности к самовосстановлению были выращены полностью органические ткани на основе молекул ДНК Годзиллы, сохранённых с 1954 года, со времени её первого нашествия. Эти образцы, бережно хранимые в архивах, стали источником биоматериалов, интегрированных в конструкцию нового защитника.
Много лет исследователи изучали геном и воссоздавали структуру мышечных волокон, кожу и энергетические цепочки, стараясь повторить биологические процессы на синтетической платформе. В результате родилась Механическая Годзилла — колосс, сочетавший живые ткани и передовые системы управления, способный реагировать на угрозы подобно оригиналу, но действующий под контролем людей. Биологическая составляющая обеспечила машине регенерационные способности и натуральные реакции, технологии — точное управление, связь и мониторинг.
Когда настоящий Годзилла внезапно проснулся и направился к японским берегам, тревога охватила страну. Звуки сирен, спешные приказы, напряжение в штабах — всё это сопровождало появление древнего чудовища, снова грозившего разрушением. В ответ на эту угрозу Меха-Годзиллу вывели на линию фронта: созданное из научного стремления и генетической памяти оружие стало последней надеждой. Столкновение двух титанов, техники и природы, должно было проверить, насколько успешно удалось воспроизвести силу и инстинкты монстра в контролируемой форме и выдержит ли новая стража испытание ради безопасности всей нации.